本页面记载《百日战纪-最终防卫学园-》中二周目的各分支与剧情。
游戏二周目共包括16个章节（Chapter00~Chapter15），21个篇章，100个结局。
Chapter00 真相大白篇
结局01 再见了最终防卫学园[1]
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回到第2天晚上的澄野首先见到的是具象化后的圣婴，将一切告知了对方。考虑到上一周目圣婴所言的“打破禁忌穿越回过去可能会发生意想不到的改变”，澄野的异血之力使所有人（包括侵校生在内）体内的异血之力都得到了增强。澄野询问了当前是什么时候，随即意识到当天晚上苍月将要袭击SIREI。 来到体育馆后澄野发现下一秒苍月就要得手了。将一切全盘托出后实力剧增的澄野轻松薄纱了苍月。SIREI对苍月的背叛表示非常气愤，随即就在复活机的数据库中删除了苍月的DNA这样一来他将再也无法复活。此时圣婴的具象化也现身并将澄野的情况告诉了SIREI。现在，澄野将决定苍月的生与死...... 【分歧点：要如何处置苍月卫人？选择：将他关押起来】（若选择“给出致命一击”则进入Chapter14/15） SIREI表示OK，用无人机运走了苍月将他关押在庭院内的笼子里。第3天SIREI将同学们召集并告诉他们苍月一事，当提到体内涌现出莫名的能量时，SIREI表示和澄野有关，众人也很想知道澄野是如何知道苍月要背叛一事，面对同学们的目光，澄野决定...... 【分歧点：要向大家坦白吗？选择：坦白】（若选择“不坦白”则进入Chapter13）
澄野决定向大家坦白一切，并与每位同学分别进行了交流，大家纷纷表示愿意参战。第4天，SIREI提前开放了所有教室，并任命澄野为队长，随后SIREI与澄野先后与被关押的苍月进行了交谈。后几日，同学们继续着日常与训练，然而澄野却隐约觉得SIREI似乎隐瞒了什么，SIREI也因出现了澄野这一意外因素而向“全人类的整体意见”请求指示。 第7天，澄野所“预言”的袭击如期而至。在迎战第一部队长——秩序之化身-穆翁时，大家目击了一位披着斗篷的神秘人，澄野推测其可能为回到过去后历史发生的改变，且因为异血能力增强的影响，现在所有人都能听懂侵校生部队长所说的话了。穆翁被击败后，告诉澄野我驱力是属于他们侵校生的力量，令澄野感到不解。此时SIREI连上通讯并让澄野等人尽快完成处刑。
为了增加战力，澄野打算赶在第十天（上一周目第二学园遭遇大规模袭击导致最终失去了丧白萌子的那天）之前将第二防卫学园的同学们都接过来，赶到时（第8天）却发现第二学园已经遇袭。奄奄一息的面影将现状告诉了澄野，目前其余情况与上一周目一致，雾藤希与萌子正在前往敌营准备夺回NIGOU。 然而此时SIREI那边也传来了急报，最终学园那里侵校生也提前发动了新一轮大规模攻击。SIREI希望澄野他们能够尽快回防避免学园被攻陷，此时的澄野陷入了纠结之中...... 【分歧点：我该营救哪一方？选择：营救第二防卫学园】（若选择“营救最终防卫学园”则进入Chapter12 诺莫科巴篇） 且不论想要帮助雾藤希（嘉琉亚）的心情，这一次如果抛弃这边不管的话说不准还会发生什么，而最终学园那里实力增强的众人应该足以应对袭击吧。澄野决定营救第二防卫学园，于是便与队员们向侵校生的营地进发。在找到雾藤后，众人一起发动进攻，在银崎高达的帮助下成功使被敌方洗脑的萌子脱离了控制，最终击败了原第五部队长信仰之化身-帕弥思。
【分歧点：要说出雾藤希的事吗？选择：说】（若选择“不说”则进入Chapter11 青春篇）
【分歧点：要让谁做敢死队员？选择：凶鸟狂死香】（若选择“厄师寺猛丸”则进入Chapter10 领袖魅力澄野篇；若选择“川奈翼”则进入Chapter10 维希涅斯篇）
第15→16天，大铃木与雾藤和好。银崎解锁新记忆，萌子将凶鸟的珍爱之物带回，兄妹之间出现隔阂。
第21天晚上第六部队长 自然之化身-依娃来袭。 【分歧点：该怎么处置依娃？选择：俘虏她】（若选择“给出致命一击”则进入Chapter09） 澄野与被关押的依娃交谈却被击晕随后失去了一部分记忆。依娃被SIREI带去了医务室。
【分歧点：要让她破坏NIGOU吗？选择：让她破坏】（若选择“阻止她破坏”则进入Chapter08 休闲篇）
【分歧点：我该救谁呢？选择：丸子乐】（若选择“大铃木梦罗”则进入Chapter07 选择篇）
【分歧点：要不要让他成为同伴？选择：要】（若选择“不要”则进入Chapter06 连续防卫篇）
【分歧点：要杀死苍月卫人吗？选择：不杀】（若选择“杀”则进入Chapter05 遍地苍月篇）
【分歧点：该怎么处置依娃？选择：交给银崎】（若选择“保护依娃”则进入Chapter04 依娃篇）
【分歧点：要为人类战斗吗？选择：战斗】（若选择“不战斗”则进入Chapter03 独裁政权篇）
【分歧点：要接纳苍月卫人吗？选择：接纳】（若选择“不接纳”则进入Chapter02 告别苍月篇）
【分歧点：要和SIREI战斗吗？选择：战斗】（若选择“不战斗”则进入Chapter01 重启篇）
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Chapter01 重启篇
结局02 欢迎来到最终防卫学园
在真相大白篇Day100，进行选择：
【分歧点：要和SIREI战斗吗？选择：不战斗】
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最后一切计划如期进行。为卸下毁灭生命的罪恶感等心理重担，全员在返回后自愿?接受了SIREI的记忆改写部分同学原先设定中的消极记忆全部被改成了积极的。雾藤希（唯一幸存的人类）与十一位同学们将一起在被不灭之火荡平后没有其他生命存在的弗特卢姆星球上开始全新的生活。 |
Chapter02 告别苍月篇
结局03 最后的心愿
在真相大白篇Day82，进行选择：
【分歧点：要接纳苍月卫人吗？选择：不接纳】
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众人不愿接纳苍月，苍月只好独自离开，临走前SIREI交给他一颗不灭之火炸弹，称如果维希涅斯来杀他，希望能在被吸收异血之前引爆它。苍月徒步走到第二防卫学园，两天后苍月遇到了一批被侵校生追杀的弗特卢姆人，苍月对其伸出援手，引导他们到学园内避难，之后在和一位小女孩的对话中理解了他们的苦衷。第二天侵校生大举进攻学园，苍月让弗特卢姆人逃跑，自己一个人拖住侵校生，随后引爆炸弹与侵校生同归于尽。在临死之前，苍月回想起了自己要求SIREI改写的与大家在一起的快乐回忆，并希望其他同学能在战斗中获得胜利，迎来幸福。 |
Chapter03 独裁政权篇
结局04~06
在真相大白篇Day77，进行选择：
【分歧点：要为人类战斗吗？选择：不战斗】
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【分歧点：要与混沌军结盟吗？选择：结盟】（若选择“不结盟”则进入结局004）
苍月与澄野认为佳缪是维希涅斯设置的陷阱，于是打算把她抓起来，在一片混乱中佳缪刺死了雾藤希后又被澄野所杀。最后澄野等防卫队员只得在人类与弗特卢姆星的战争中夹缝生存。
佳缪逝去后弗特卢姆人失去了领袖开始内战，地球军也加入了战争局势一片混乱。继承了佳缪的遗志的雾藤与澄野开办了一所学校，希望向更多人传递爱与和平。
15年后，澄野与佳缪成功在弗星与地球的各方势力间翰旋，最终达成了停战协议，实现了雾藤的心愿。 |
Chapter04 依娃篇
结局07、08
在真相大白篇Day63，进行选择：
【分歧点：该怎么处置依娃？选择：保护依娃】
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澄野决定保护依娃，部分同学支持部分反对，银崎在纠结之后仍持刀冲向了依娃，却被陷入混乱中的依娃反杀并被吸收了异血。之后依娃陷入了昏迷，醒来后仍保持着洗脑的状态不记得自己杀死了银崎，众人先将依娃当作俘虏继续关押，打算杀掉依娃的声量也逐渐变大... 澄野后续时不时地来看望依娃，并通过复述从她口中得知的女儿“佳缪”唤醒了依娃原本的记忆。澄野与恢复记忆后的依娃进行了许多交流加深了彼此之间的理解，最终决定在SIREI将被修好的第71天之前偷偷放走依娃。 谁知翼神提前修好了SIREI，并使得它注意到了澄野的背叛行为，在第70天澄野即将放跑依娃时带着几位同学现身。千钧一发之际早已逃跑的苍月丢了颗闪光弹让澄野与依娃获得了逃跑的机会。 澄野与依娃出逃前苍月将装备与行囊交给他们随后目送他们离开，随后在与雾藤希的交谈中得知她也参与了计划的一部分。澄野二人出逃后比留子尝试说服SIREI暂时不要引爆澄野体内的炸弹，SIREI在考虑后表示同意。 澄野与依娃最后抵达了依娃养女佳缪所领导的混沌军据点，过上了一阵和平安逸的生活。不久后澄野得到消息，维希涅斯将要对学园发动总攻，于是澄野决定... 【分歧点：营救最终防卫学园吗？】
依娃自然看透了澄野的心，便与其一同去营救。在决战的过程中依娃爆发出了惊人的能量，最后与维希涅斯同归于尽，弥留之际向澄野做了最后的告别。
很快维希涅斯吸收了全部力量成为新神，佳缪的混沌军也分崩离析，澄野只得与怀上了孩子的依娃一起浪迹天涯。 |
Chapter05 遍地苍月篇
结局09~012
在真相大白篇Day57，进行选择：
【分歧点：要杀死苍月卫人吗？选择：杀】
Chapter06 连续防卫篇
结局013、014
在真相大白篇Day52，进行选择：
【分歧点：要不要让他成为同伴？选择：不要】
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澄野经过考虑后没有让汐音加入防卫队，汐音对此表示理解。Day57的防卫战中，投靠侵校生的苍月刺杀未遂想要逃跑，此时汐音出现并将其拦住，随后引发爆炸将苍月蒸发，但也因此使得自身陷入极度虚弱的状态，导致不灭火墙的强度被大幅削弱，敌人的攻势将更为频繁猛烈。 接下来直到Day99一共要打20多场防卫战，顶级坐牢体验 第99天特防队发现居然要打两个牢维，随后得知牢维找到了一台能让人跳跃到其它时间轴的设备，从那里把部队长们与另一个牢维也带了过来。特防队在历经一番苦战后艰难地取得了胜利。第100天，遥望着守护至今却也已经残破不堪的学院，澄野觉得... 【分歧点：战斗......】
尽管这次依旧有伙伴牺牲（连续防卫篇分支前的饴宫、凶鸟与大铃木），不过剩下的成员们一起奋战到了最后。澄野决定与大家一起坐上逃生舱，为战斗画上休止符。
这次依旧有未能拯救的伙伴，于是澄野决定再重启一次百日战纪。雾藤对此表示担忧，不过澄野心意已决。 |
Chapter07 选择篇
结局015~022
在真相大白篇Day33，进行选择：
【分歧点：我该救谁呢？选择：大铃木梦罗】
Chapter08 休闲篇
结局023、024
在真相大白篇Day31，进行选择：
【分歧点：要让她破坏NIGOU吗？选择：阻止她破坏】
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澄野不希望NIIGOU被破坏，却也发现自己的记忆好像的确存在问题；此时SIREI出现使用电棍击晕澄野并对其进行更彻底的洗脑改造。 在后续的日子里，澄野发现死去的饴宫凶鸟都还健在，苍月也没有逃跑；悠闲的生活让澄野执着于“是否会把盒装牛奶喝干净”、“谁偷了大家的袜子”等小事。 第48天澄野发现厄师寺在与面影进行德州扑克对决，随后打算帮助厄师寺完成扑克特训。在又一次向笼子里的苍月寻求建议时，也逐渐发现了目前自身的状况很不对劲。 与达尔沙一战后澄野负伤倒下，周围的同学们其实早已发现澄野的种种不对劲之处，澄野心中的异样感也迫使其在醒来后意识到了所处“现实”的荒谬，这时SIREI再次出现，将洗脑一事告知了澄野。由于目前防卫战已无获胜的可能，SIREI便给澄野一蓝一红两颗药丸，让他做出最后的选择... 【分歧点：选择现实还是梦境呢？】
澄野吞下了红色药丸回到了现实，同学们已被团灭，澄野抱起奄奄一息的雾藤与她告别后加入了战场。
澄野吞下了蓝色药丸...随后看到所有同学齐聚一堂喝起了盒装牛奶。 |
Chapter09
在真相大白篇Day21晚上，进行选择：
【分歧点：该怎么处置依娃？选择：给出致命一击】
幸运之匣篇
结局025~032
Day22晚上，进行选择：
【分歧点：要选择去找哪边？选择：过子】
灾厄之匣篇
结局033~040
Day22晚上，进行选择：
【分歧点：要选择去找哪边？选择：人影】
| 结局033~036 |
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各种异常状况出现。Day23晚上教学楼中一位手持镰刀的神秘人逼近雾藤，背后同时有人在喊澄野。 【分歧点：该怎么办？】
澄野依旧没能就下雾藤，目睹了惨状后连续昏迷70多天直到第100天醒来，其他同学似乎都消失了，最后在泳池发现了奄奄一息的比留子，此时真凶出现，澄野定睛一看竟是过子...
回头一看比留子及时赶到并拿来了我驱力刀。后面过子失踪、面影之死等异常状况持续发生。
Day33迎战第3部队长 憎恨之化身-亚达乌奇；Day36苍月逃跑，Day37像是依娃的幻觉女鬼再度现身，引澄野到图书馆让后把澄野掐晕，火人破译特殊的书籍。
Day39今马劫持雾藤希做为人质，Day40主动出击攻打侵校生营地并迎战第4部队长 丑恶之化身-昆德烈。Day47迎战第10、11部队长。Day49食堂里萌子身亡，此时SIREI突然通过广播告知NIGOU死亡与遇袭之事，然而食堂里的幻觉女鬼让澄野把匣子捡起来藏好... 【分歧点：该怎么做？选择：去救SIREI】（若选择“捡起匣子”则进入结局037~040） 等赶到的时候SIREI已经寄了。之后把幸运之匣给今马，里面有一只染血的玩偶。随后澄野救出雾藤，比留子打晕今马将其关押。Day55幻觉再现，比留子告诉澄野是他自己掐住自己脖子。Day56发现今马死亡，Day57迎战第7部队长 和谐之化身-禅泰。
Day58比留子告诉澄野自己多次重复了这100天的历史，过子因为打开匣子成为杀人凶手，因此这一次先将过子绑架了。 Day63新一波敌人来袭，Day64比留子将平行世界穿越设备一事告知澄野，无法跨越时间只能前往平行世界的同一天，她把失控的过子送往了其他平行世界，苍月Day36也穿越到其它平行世界顺带毁掉了设备。Day65~Day71澄野与厄师寺一直都在找匣子。 Day73发现大铃木死在一楼的教室，丸子认为要驱魔，比留子认为幽灵什么的都是无稽之谈。 【分歧点：要赞同谁的观点？选择：赞同雫原】（若选择“赞同丸子”则进入结局036） Day76从火人那里得知幸运&灾厄之匣的传说。Day77厄师寺独自外出探索匣子，失踪数日后于Day84晚上现身不过明显不对劲。Day86晚上行为怪异先杀了丸子随后向川奈扑去，被掌握了SIREI技术的川奈引爆身体内的炸弹，随后众人发现了厄师寺脑内的寄生物，将其消灭。
Day87第0部队长 霸道之化身-达尔沙来袭。Day89火人将有关灾厄之匣与叽的事悉数告知雄性叽会在青蛙等动物的体内排精，其后被女王叽的宿主捕食。Day90川奈表示可以开发出识别幸运之匣指纹的功能，Day92发现除澄野外上面还有晶马的指纹，晶马认罪并被绑。 Day93达尔沙再次来袭，在看到疑似女鬼并交谈后扬长而去。比留子后续证实晶马在说谎。Day99晚澄野发现玩偶突然袭击比留子，及时阻止后二人再审晶马，得知那只玩偶里面是晶马由于思念狗狗列欧而悄悄养着的，被雄性叽附身的生物。正当晶马要指认真凶时警报响起敌人来袭。 大将军气势汹汹地来袭结果被仅剩四人+火人的澄野他们干掉。回头去找银崎发现其已惨遭杀害。Day100即将登上逃生舱时，澄野经过推理确认了真凶的身份... 【分歧点：我该怎么办？】
由于女王叽只能在其它女王叽留下的尸体上产卵，而银崎的尸体上没有异变，因此只存在一只女王叽。且因为川奈拥有控制SIREI的技术无需将其杀掉，因此犯人只能是雾藤。 除被雄性叽附身的生物玩偶杀掉的今马、萌子（被刺多处）以外，面影大铃木（吊死+脚踝放血）晶马都是被附身的雾藤干的。早在Day26之后雾藤就被寄生了。 “雾藤”认为同学们应该下不去手将自己除掉，关键时刻川奈引爆了雾藤体内的炸弹，众人将暴露出的女王叽杀死。最后澄野比留子川奈三人怀着复杂的心情登上了逃生舱，启程前往人造天体。
思绪紊乱的澄野没有登上逃生舱而是独自一人回到房间，“雾藤希”随后来到了澄野身边，感谢他没有指认自己。一番饱含深情的交流后，澄野闭上了双眼，平静地等待着死亡的降临。
选择“赞同丸子”后，丸子与澄野因为害怕怕诅咒所以一直在做驱散灵魔的法事，其他人纷纷表示受到了严重的精神污染......所幸从他们开始做法事以后再也没有新的牺牲者出现。登上飞船前丸子表示到了人造天体以后也要继续驱魔哟。 |
| 结局037~040 |
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【分歧点：该怎么做？选择：捡起匣子】 澄野将匣子藏起来以后没有将其交给今马，与今马对峙时女鬼出现房间开始晃动，比留子乘乱打晕今马，雾藤得救。火人告诉澄野增强异血之力后或许能和女鬼对话。 Day56晚上匣子里的玩偶突然袭击澄野，比留子及时赶到将玩偶剖开发现了谜之生物的存在，澄野私藏匣子一事也被暴露。Day57迎战第7部队长 和谐之化身-禅泰，击败禅泰后澄野将其异血吸收。 后来澄野能够看到幽灵的本体是通过异血之力残存的依娃，依娃告诉澄野自己故意把幸运之匣一事告知是因为她也分不清幸运和灾厄之匣的区别，也不知道灾厄之匣里有什么。房间的晃动也是她造成的。 原先依娃想诱导他们开匣子做为报复，当看到澄野他们只是一群孩子后自己改变了想法。听到依娃说自己将已故兄嫂的孩子视如己出，便去寻找那个孩子所在的村庄，不过这一行为被其他看不见依娃的同学所怀疑。Day72晚上分支出现： 【分歧点：我该如何选择？选择：对看到的东西避而不谈】（若选择“将看到的东西告诉大家”则进入结局039、040） 今马突然逃了出来袭击澄野，被击晕后继续被关押。之后依娃恢复了女鬼形态，澄野认为或许是对自己坚持选择消灭侵校生的报复。之后澄野自带血腥滤镜，一日遭遇雾藤袭击后侥幸逃生。 Day82川奈死亡，Day91大铃木死亡（吊死+脚踝放血），Day92银崎死亡（被刺多处）。Day87第0部队长 霸道之化身-达尔沙来袭。Day93达尔沙再次来袭，在看到疑似女鬼并交谈后扬长而去。 Day94澄野跟着丸子跑进森林，只见厄师寺比留子雾藤三人倒在血泊之中，丸子突然出现并指认是澄野杀了所有人，随后举刀冲了过来... 【分歧点：该怎么做？】
澄野反杀了丸子，随后意识模糊，最后一刻恍惚间回到了图书室，被女鬼掐着脖子，女鬼告诉澄野大家都是被你害死的。
丸子发现杀不死澄野，澄野居然还在笑。丸子逃跑后，女鬼再次现身，澄野意识到除依娃外还存在另一个女鬼（幽灵），经由我驱力创造而出，代表着自己心中的负罪感。 【分歧点：我该如何选择？选择：将看到的东西告诉大家】 同学们听闻侵校生村庄的消息后，分成了不希望导弹把星球上所有生命燃烧殆尽，与必需对敌人重拳出击两派。Day80依娃残存的力量不足即将消失，与澄野告别时让他不要太过纠结这些事情。依娃消失后同学们之间的氛围变得融洽了起来。 Day87第0部队长 霸道之化身-达尔沙来袭。Day92，雾藤希将复活机中的解析程序设置完成，用以检测依娃是否是通过澄野的异血之力维持存在。此时分支出现： 【分歧点：我是怎么想的？】
澄野做出回答后雾藤很快用镰刀偷袭，澄野只得一路逃跑，最后发现所有同学都及时赶到，比留子引爆了雾藤体内的炸弹。事后复盘发现真正的雾藤应该早就死去了，而大家是因为房间晃动才注意到异常的，依娃是好人。 Day93达尔沙再次来袭，在看到疑似女鬼并交谈后扬长而去。火人告诉大家想要阻止导弹发射必需先找到相关的电子设备并破坏掉。澄野他们在第99天完成了这一工作，谁知维希涅斯突然来袭众人不敌，此时幽灵形态的依娃背刺牢维完成关键一击。 第100天大家完成了导弹的拆解工作。在所有人即将启程之际澄野自愿留下。澄野打算找到依娃养女所在的村庄，把依娃的功绩传播到五湖四海。
澄野说着说着就似了。Day93达尔沙再次来袭，澄野在作战室看到了所有同学，达尔沙被击败后爆炸而亡。Day99大将军来袭后发现自己好像遇到了不死军团，随后自爆。Day100澄野恍惚间看见了包括自己在内所有人的尸体，耳边只回荡起雾藤希的放声大笑。 通过前面线路中的线索推测，很有可能是被女王叽附身的雾藤希杀穿了所有人，澄野的尸体可能被其它未知来源的雄性叽附身？也可能是澄野在被杀死之后，由于残存的异血之力而持续出现各种幻觉。 |
Chapter10
领袖魅力澄野篇
结局041、042
在真相大白篇Day15，进行选择：
【分歧点：要让谁做敢死队员？选择：厄师寺猛丸】
维希涅斯篇
结局043、044
在真相大白篇Day15，进行选择：
【分歧点：要让谁做敢死队员？选择：川奈翼】
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然而川奈翼并没有胆量动手引爆炸弹，维希涅斯不费吹灰之力便赢得了全面胜利，带领众部队长占领了学园，将除澄野外的其他同学关在各自的房间里看守，只有川奈能在外活动为他们送饭与打杂。 澄野被维希涅斯单独关进了休息室，维希涅斯对其十分感兴趣，便与他在接下来的日子里进行了许多次一问一答小游戏，并告诉澄野自己的回答中只有一个是谎言。 与此同时第三部队长亚达乌奇也在策划着对维希涅斯的反叛行动，并经由与川奈进行沟通将此事告诉了她；NIGOU也在暗中活动为澄野传递信息。第28天叛乱即将发起，维希涅斯告诉澄野她将会杀掉其他所有人，此时澄野决定... 【分歧点：我应该做的是......】
澄野决定动手，不过维希涅斯早有预料并轻松制服澄野，在他的脖子上套上锁链后带着澄野将敌我双方所有人尽数杀死。最后与达尔沙对战将其击败，维希涅斯让澄野吸收所有尸体的异血最终与自己决战，澄野别无选择。二人决战了数日后澄野倒下，维希涅斯来到防卫室前，胜券在握的同时也感受到了身为强者顶点的孤独。
澄野并未能将其说服，维希涅斯不分敌我双方大开杀戒，受了重伤的亚达乌奇决定让川奈将自己吸收。不久后拿到我驱力刀的同伴们朝着休息室赶来，第11部队长尤拉梦达米打算先将澄野了结，谁知维希涅斯突然出现为澄野挡刀，澄野也希望能救下负伤的维希涅斯，此时川奈出现为了保险起见将二人贯穿，维希涅斯带着澄野用尽最后的力气逃出学园，最后二人幸终。 |
Chapter11 青春篇
结局045~048
在真相大白篇Day11早上，进行选择：
【分歧点：要说出雾藤希的事吗？选择：不说】
Chapter12 诺莫科巴篇
结局049~052
在真相大白篇Day08，进行选择：
【分歧点：我该营救哪一方？选择：营救最终防卫学园】
Chapter13
SF篇
结局053~060[2]
以下内容含有剧透成分，可能影响观赏作品兴趣，请酌情阅读
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【分歧点：要向大家坦白吗？选择：不坦白】 之前圣婴说过直接告诉大家可能会使历史发生剧烈改变，那么，在知道未来的情况下慢慢引导他们...澄野撒了个慌说无意间看到了苍月的笔记本上写着阴谋，将信将疑的众人立马跑去庭院质问苍月。SIREI却不紧不慢表示就算苍月说谎自己早已录下证据。SIREI问澄野上一个轮回都知道些啥，澄野如实道来（雾藤的部分除外），SIREI听完后流露出微妙的神情。 苍月决定配合澄野撒谎。SIREI后续如约告诉众人真相，所说的内容没有超出澄野的情报获取范围，或许同时受到体内力量增加的影响所有人都表示愿意参战。晚上，比留子识破了澄野的谎言并意识到他是从未来穿越回了现在。面对震惊的澄野比留子并没有透露更多事情。
第4天晚上澄野意外发现比留子和SIREI之间好像在做什么交易，随后又无意间目睹到独自穿越不灭之火墙外出的比留子，决定跟踪之。比留子在一个设施内穿上了防护服准备启动设备，澄野突然冲了上去想要问个究竟，于是和比留子一起经历了一段传送...... 由于没穿防护服，澄野在此过程中眩晕了一段时间并全身出现不适症状，比留子让澄野待在原地不要动，但澄野却一路跟进了学园，发现某特殊教室（后续可知是停尸房）中居然有着苍月的尸体（非木乃伊化），随后在复活室见到了比留子，却被对方掐住了脖子，随后晕厥过去...某一瞬间恍惚间醒来看到复活室的棺材内好像装着某人。彻底醒来后与比留子一起返回设施内，穿上防护服后一同传送了回去。 尽管澄野此时心中涌现出数百个想要问比留子的问题，不过对方告诉他接下来几天只要听从自己的指挥做事并不要追问，就会在第9天晚上将所有的事情都告诉他。第一件事就是重返第二防卫学园将那边的学生以及NIGOU接回，为后续的防卫战做准备。
在迎战第一部队长——秩序之化身-穆翁时，大家目击了一位披着斗篷的神秘人，澄野推测其可能为回到过去后历史发生的改变，且因为异血能力增强的影响，现在所有人都能听懂侵校生部队长所说的话了。穆翁被击败后由于声带受损无法发声，SIREI和NIGOU从后方发来指示让学生们给其最后一击。众人战后开了Party，澄野早到并目睹了比留子与SIREI、NIGOU的交谈，不过依旧没有获得任何新情报。 第二天，第二防卫学园的众人在见到苍月并听取其心声后打算放他出来并让他也加入战斗，不过比留子的一席话让他们打消了这个念头。在击败第二部队长——美德之化身-帕珂伦后，昨天的兜帽神秘人现身，揭开面具一看正是敌方统帅大将军。对方自报家门说自己是希望之化身-维希涅斯，打算调查突然增强的异血力量而来到此地，随后带走了战败的帕珂伦，意在不再继续让防卫学园的众人吸收异血，并撂下了一句“想要日后慢慢虐杀你们让你们感到绝望”的话后泰然离去。战后，比留子提示下一次进攻将发生在第15天。
第9天一早苍月突然溜了，厄师寺在复活机房间找到他并打算狠狠揍他，澄野上去阻拦谁承想厄师寺没控制好力度将澄野打飞并使其撞坏了复活机。SIREI、NIGOU赶到并开始修复，众学生将苍月押解回去，询问他是咋越狱的，苍月坚持说是同学中的某人帮他，不过侦探过子通过现场痕迹推理他是独自完成越狱的。保险起见众人将苍月换了个房间关押。 晚上，比留子独坐啜泣，澄野上前询问但对方表示没有哭哦。澄野想要让比留子兑现第9天晚告知一切的承诺，比留子提出了最后一个要求：吻我。 【分歧点：要亲吻雫原吗？选择：不吻】（若选择“吻”则进入坠入爱河篇） 比留子离开了，澄野并没有挽留。在第10天的自由时间，澄野向众人询问比留子喜欢什么礼物的同时也在收集苍月是如何逃跑的线索 已到达剧情锁定地点1，需达成特定的【解锁条件】才能继续前进。解锁条件：到达结局34、36、72、76，到达剧情锁定地点3（推理篇Day82）
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| 结局053~056 | ||
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【分歧点：要跳跃到哪条TL去？选择：青春TL】
澄野和比留子跳跃去青春TL，确认了怠美的尸斑编号是“5”。 时间转到第67天，苍月和川奈发明了能发送特殊电磁脉冲的激光枪。由于澄野大部分时间和比留子一起行动，很少与其他同学交流，大家绷紧神经度过了这66天，澄野决定在接下来的三天和大家一起进行娱乐活动。众人在第68天举办泳池派对，在第69天逛庙会，最后在第70天在天台放了一场烟花。 第71天，比留子告诉澄野自己做了一个梦，梦到在第101天除了她以外的所有人都在人造天体上，而她永远被困在了这个循环，澄野安慰了比留子。比留子和澄野玩“猜硬币”的游戏，如果澄野猜中了，第73天比留子和澄野一起外出探索，如果没猜中就什么都不做。 【分歧点：硬币的哪一面朝上？选择：正面】（若选择“反面”则进入结局056）
澄野猜中了图案。第73天，比留子和澄野一起去洋楼探索，并告诉澄野自己想让没猜中硬币TL的澄野和比留子协助自己获取尸斑编号。第74天比留子和澄野跳跃到没猜中TL，告诉大家目前只剩下厄师寺，今马，澄野和比留子的尸斑编号没有被确认， 四人经过讨论分配了任务：没猜中TL的二人去杀人魔TL，确认厄师寺的尸斑编号，猜中TL的二人去丧尸TL，确认今马和比留子的尸斑编号。之后，二人回到自己所在的TL，让川奈帮忙制作了透视目镜，以便观察丧尸的尸斑编号。随后，二人在第79天跳跃至丧尸TL，确认了今马的尸斑编号“1”和比留子的尸斑编号“4”。第84天，没猜中TL的二人与他们交换了尸斑编号，得知厄师寺的尸斑编号是“7”。在交流完后，没猜中TL的二人试图跳跃回他们的TL，但时间已过，他们回不去了。 第85天，二人带着其他同学进入地下室，输入了八位同学的尸斑编号。 【分歧点：要按下按键4吗？选择：不按】（若选择“按下它”则进入结局053）
澄野按下了数字4，随后学园在一阵爆炸中灰飞烟灭。全作最简陋最敷衍的结局之一
第86天，在告别另一个TL的二人后，二人带同学们跳跃到按下4后的TL，见证了在这之后学园遭到爆破的惨状，比留子跳跃后身体出现不适。第87天达尔沙来袭，澄野在比留子提醒下顺利躲过达尔沙的攻击。第88天二人从SIREI口中得知，求救发信机是假的，其本质是由人类高层设置的启动“同归于尽计划”的装置，当特防队十人中其中九人彻底死亡时，让最后一人启动装置引发爆炸，与侵校生同归于尽。第89天，众人得知不灭之火导弹侵袭后汐音也会死亡，希望通过研究生命维持设备救出汐音。
第90天，二人跳跃至青春TL获得Ω物质，之后交给川奈用来研发生命维持设备（婴儿广口瓶），第91天SIREI和NIGOU前来组织，被川奈用激光枪破坏使其暂停运作。第93天达尔沙再临，被众人击败。第94天众人发现飞船被基本粒子细菌完全腐蚀。第98天，怠美提出计划，让众人跳跃到其他TL并使用那里的逃生舱，但澄野认为这样会杀掉另一个TL的众人，因此否决了这个提议。当天晚上，澄野发现比留子不在，通过追踪PL记录跳跃到杀人魔TL，发现比留子在看着这条世界线的比留子和澄野
第100天，澄野根据此前发生的事情，提出了一种逃生的可能性。
澄野带着众人用婴儿广口瓶救出汐音，然后带上SIREI和NIGOU跳跃至猎杀TL，但到达时众人发现，在特防队全灭之后，人造天体上的人类把汐音的克隆体带到学园里给导弹充能，因此这条线上还会发动全方位攻击。比留子因穿着带破洞的防护服PL三次，发生PL障碍倒下。 【分歧点：我最后的决定是......】
澄野抱着比留子奔向逃生舱，随后全方位攻击发动毁灭了星球上的其他生命。全员存活，但在逃生舱内的伊娃受到冲击解除洗脑，意识到自己的女儿实际为其养女的佳缪在攻击中死亡的她发誓要消灭人造天体上的所有人类。
比留子带着澄野去地下室，在澄野即将炸毁学园以防止全方位攻击进行的时候，其他同学赶到地下室。众人接力抱着比留子去逃生舱，在全方位攻击即将发动的同时，汐音启动装置将学园炸毁，解救了这颗星球上的其他生命。特防队全员存活，澄野和比留子所经历的时空循环也在众人生命的力量下打破。
澄野没有猜中图案。第73天，比留子和澄野在教学楼附近发呆，并告诉澄野自己的计划。第74天猜中TL的比留子和澄野跳跃到这里，告诉大家目前只剩下厄师寺，今马，澄野和比留子的尸斑编号没有被确认， 四人经过讨论分配了任务：没猜中TL的二人去杀人魔TL，确认厄师寺的尸斑编号，猜中TL的二人去丧尸TL，确认今马和比留子的尸斑编号。随后，二人在第79天跳跃至杀人魔TL，确认了厄师寺的尸斑编号“7”。第84天，二人跳跃到猜中TL，与猜中TL的二人交换了尸斑编号，得知今马的尸斑编号“1”和比留子的尸斑编号“4”。在交流完后，二人试图跳跃回他们的TL，但时间已过，他们回不去了。 在等待32小时后，二人返回了自己的TL，在庭院三楼休息室发现了其他同学的尸体，随后凶手出现并砍断了二人的脖子。过子G在第84天从推理TL跳跃到这条线，并杀害了这条线的所有人。 |
| 结局057~060 |
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【分歧点：要跳跃到哪条TL去？选择：杀人魔TL】
【分歧点：明天的防卫战我要......选择：出战】（若选择“不出战”则进入结局060）
比留子认为澄野做出了明智的选择。Day73晚，比留子告诉澄野上一次并没有跳跃到杀人魔TL上而是因为澄野的失误跳跃到了丧尸TL，由于此时叽的融合程度更深因此已无法再对澄野G进行治疗。Day74晚澄野决定独自跳跃到杀人魔TL去了结澄野G，遇到了杀人魔TL上的澄野与雾藤后开始了追击。然而在面对这条线的自己时，澄野最终没能下得去手，反而被完成了人格切换后的澄野G袭击。澄野G随后脱下了澄野的防护服并给他换上仿制的学生铠甲，以交换二人的身份，最后用电锯切割澄野的后背并杀死了他。
【分歧点：我要扑向过子G吗......选择：扑过去】（若选择“不扑过去”则进入结局057）
澄野担心PL障碍造成的影响没有第一时间扑过去，只得眼睁睁地看着过子G与雾藤完成了跳跃。随后与比留子二人一起追了上去，搜寻未果后不听比留子的劝告执意一个人留在这条TL上继续搜索，结果依然一无所获。第100天上午10点不灭之火导弹如期发射，澄野在懊悔中化为了灰烬。
澄野佯装并无大碍硬撑着加入了作战，最后大家靠着汐音与毒气陷阱击败了维希涅斯，欣慰的澄野最终力竭而亡，在众人的拥簇下死去。
作战开始后澄野一时间陷入了昏迷，Day100醒来后生命体征也依旧很微弱。比留子告诉澄野用来转移汐音的婴儿广口瓶不见了被推理TL的比留子顺走的。不久后澄野命悬一线，在将要撒手人寰之际回想起了推理TL的记忆，并让比留子带同学们一起跳跃到第100天不会发动全面攻击的推理TL上去。 与结局100 第100天的访客互为“拼好饭”结局 同学们相认后，比留子独自一人跳回了原来的SFTL，抱着澄野的尸体许下了一定要脱离无限循环的誓言。 |
坠入爱河篇
结局061~068
【分歧点：要亲吻雫原吗？选择：吻】
Chapter14
鲜血淋漓篇
结局069~076
| 结局069~072 | ||||
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【分歧点：要如何处置苍月卫人？选择：给出致命一击】 澄野吸收了苍月的异血，SIREI认为做得好，不过圣婴却对此表示不安。第3天，SIREI将一切告知其他同学，不过大家并不相信澄野，且认为击杀苍月的行为欠妥，澄野将上个一百天的全部内容告知（雾藤的部分除外）后众人仍表现地将信将疑。SIREI决定给苍月的遗容化个妆让他看起来安详一些。第4天一早比留子和澄野率先来到停尸房瞻仰了苍月的遗容，随后丸子发现了一个不得了的事情...
教室中的黑板上用血色字体赫然写着“立刻滚出这所学园，否则我会大开杀戒”。某人的恶作剧？不过大家很快发现SIREI被四分五裂了，澄野惊觉和一周目时一模一样，尽管这次已经提前排除了苍月。面对黑板上的警告，澄野认为...... 【分歧点：是否应该离开学园呢？选择：暂时离开】（进入Chapter14，若选择“选择留下”则进入Chapter15） 澄野将顾虑告知众人，部分同学认可而另外几位同学对澄野的“穿越者”身份仍表示怀疑并不愿离开学园。澄野只得软硬兼施同时故弄玄虚暂且说服了他们。离开学园后澄野带领众人前往第二防卫学园接人，NIGOU仍选择留下。
两伙人合流返回学园已是第7天，黑板上的警告仍在，而侵校生突然来袭，和上一周目的节奏也不一样。众人在战场上看到了披着斗篷戴着兜帽的神秘人，澄野认为或许历史的走向已经发生了相当程度的偏差。击败第一部队长后，澄野发觉由于异血之力增强所有人都能听懂部队长的话，正打算进一步询问时面影率先抢走了人头。 第8天意料之外的事再次发生，大量侵校生提前来袭，结束战斗后众人得到了第二学园NIGOU那边的讯息，并派出小队亲自前往查看最后证实了那边的沦陷与NIGOU的死讯。第11天，怠美在图书室发现了疑似学园里的杀人魔留下的笔记。第14天晚上，比留子告诉澄野明日会有敌袭，澄野震惊。 第15天，不屈之化身-巴拉加卢索与救赎之化身-莎恩辛两位部队长同时攻了过来，并合体成为巴拉加卢辛，击败二者后在比留子的指示下澄野让川奈利用先前制作的不灭之火炸弹完成了补刀。晚上澄野的头痛又犯了，而这次一睡就是一整天，第16天晚上澄野在迷迷糊糊中意外发现自己被搬到了生物药品室...
生物药品室中比留子也瘫坐在地上，而一位全副武装的陌生人正举着电锯逼近比留子，澄野急忙与之展开搏斗，并与其一起摔落在教学楼外，随后电锯人追击澄野被逼得无路可走。面对着紧逼的电锯，澄野决定...... 【分歧点：我要如何应对？选择：猛踢敌人小腿】（若选择“躲开攻击”则进入喜剧篇） 澄野这一脚使得攻守之势异也，电锯人跑进教学楼后澄野无奈跟丢。
澄野总是感到饥饿与头痛。澄野多次调查杀人魔日记与校史。比留子好像一直躲着澄野。Day21俘虏依娃。Day25发现依娃被杀死，之前保管的电锯失踪。Day31根据火人的线索找到了电锯，晶马找到防护服，澄野设定密码6914将其锁在柜子里。 Day33第3部队长 憎恨之化身-亚达乌奇来袭，随后大将军维希涅斯抢人头，与澄野他们交手失利后撤退。川奈制作出了生命迹象检测仪，发现数字是15，比目前的14人多了一个。 Day38面影在与丸子争执后一度产生了想要将他杀掉的想法。Day40澄野等人去火墙外探索，发现侵校生基地里面已经横尸遍野。丸子与怠美看到了2只谜之生物。Day42丸子怠美乘校车往返一日游对大家说是去取我驱力刀。 Day43澄野与雾藤萌子一起去找学园里动静的来源，不久后发现萌子被杀，穿着防护服的电锯人再次出现，澄野雾藤被逼近一间教室中，此时... 【分歧点：我要......选择：撞破窗户】（若选择“躲开攻击”则进入结局073~076） 澄野抱着雾藤跳向窗外，自己因为磕破了头被放进复活机直到第46天才醒来。众人发现放在柜子里的防护服和电锯都不见了。
Day47第10部队长 慈悲之化身-纽嘉恩克与第11部队长 梦想之化身-尤拉梦达米来袭，比留子提前发给大家耳塞避免幻觉产生。战斗结束后两个部队长都被特防队员吸收。 Day50晚上众人在食堂举办派对。Day51发现厄师寺死在房间里，众人提议在体育馆集中就寝，轮流值班。Day57第7部队长 和谐之化身-禅泰来袭。 Day59澄野在图书馆中找到新线索发现杀人魔有关的书中内容是虚构的。Day64晚上大铃木独自离开体育馆，澄野跟上前去二人偶遇电锯人，澄野将其引到防卫室门前在将要被杀之时突然神志不清...第二天澄野安然无恙，大铃木的尸体被发现。 Day67~71澄野莫名连着昏迷了数日。Day72与侵校生作战后维希涅斯通过投影发来宣战布告。比留子约澄野Day74凌晨1点在食堂见面，雾藤此时也想和澄野交流一下上个100天里他俩的关系... 【分歧点：要接受谁的邀请......选择：雾藤希】（若选择“雫原比留子”则进入结局071、072） 澄野与雾藤二人外出，正当澄野想告知一切时电锯杀人魔再度出现，二人分头逃跑，澄野跌落楼梯后再次看到了举着电锯即将挥下的电锯人...这一次澄野被击杀，第一视角转向雾藤一侧，雾藤发现了澄野的尸体，感到十分悲痛。 后来大家接二连三的被杀死。第98天凌晨川奈来到雾藤房间想要一起睡觉，二人贴贴后发现杀人魔来了而且想用电锯强行破门，只得从窗户逃跑一路来到工作技术室，川奈上前和杀人魔搏斗不幸身死，杀人魔却很快离开。 幸存的雾藤与晶马狂死香发现目前生命检测仪显示的数字是5。随后维希涅斯入侵，三人靠着川奈开发的生物武器将其击败。Day100导弹广播与逃生舱如期而至，此时杀人魔突然现身并用电锯破坏了逃生舱。 在雾藤的提议下三人跑到停车库，驾驶校车向火墙外冲去，不久后杀人魔突然在车前出现，雾藤见状毫不犹豫地撞了上去，谁知那杀人魔被撞了以后竟来到了车顶并用电锯破开车体进入其中，此时... 【分歧点：我应该怎么办呢......】
雾藤按下灭火器按钮，独自冲上前去与杀人魔一起破出窗外，校车穿过火墙雾藤认为姑且保下了剩下二人。杀人魔被短暂撞晕，雾藤揭开头套，看到了不可置信的一幕...杀人魔很快用玻璃碎片刺向雾藤，在生命的最后一刻雾藤与其对视，心中充满着困惑...
雾藤不顾一切地向火墙冲去...校车撞到混凝土墙后来了个急刹车，杀人魔因惯性冲出车外被不灭之火吞噬。火墙外，不知导弹何时来袭的三人漫无目的地徒步向远方走去...
【分歧点：要接受谁的邀请......选择：雫原比留子】 结果因为面影的乱入比留子什么也没有说。Day77晚上澄野在男厕发现晶马的尸体。Day79从今马兄妹那里得知似乎出现了两个澄野？Day80晚体育馆着火，澄野与怠美遇见杀人魔，分头行动后第二天怠美在休息室泳池被杀。 Day82今马兄妹再次提出看到过另一个“澄野”，Day83兄妹在告知澄野设置了杀人魔诱捕器后被发现死在了生物药品室里。Day86晚众人得知杀人魔也会偷食物于是事先埋伏，发现了携带奇怪仪器的侵校生，比留子将其丢出后发生了爆炸，生命监测显示7人与目前的人数一致。 众人由于不信任彼此再度分开就寝。Day87第0部队长 霸道之化身-达尔沙来袭，澄野梅开二度掉了脑袋又接头霸王。川奈解析了侵校生残留的零部件发现与杀人魔的行动轨迹对不上。Day89晚川奈去操场捡到了侵校生掉落的储存器。
随后川奈与澄野遭到杀人魔的袭击，从楼梯上将其制服后发现其真身是面影。面影坦白为了欣赏同学们逃命时的绝望神情而假扮成杀人魔，比如说Day64防卫室前和Day80怠美那次的杀人魔都是面影假扮的。关押了面影后，丸子提议将杀人魔的服装电锯藏到图书室。 Day90发现了丸子的尸体。Day91比留子将自己也是穿越者一事告知澄野，并回想起了其它世界线灾厄之匣篇结局037、038前面澄野追丸子到森林里发现三人尸体的那次自己临死前的回忆，认为大家只要留在学园里一定会发生灾难，因此最初自己才在黑板上写下血字警告。 Day92面影死去，晚上火人时隔许久再次现身，似乎和之前一样有什么难言之隐。Day93达尔沙再次来袭，被击败后维希涅斯上前抢人头，并留下同真相大白篇相似的决战预告。Day94发现凶鸟被电锯人破开房门杀害，比留子在饮水机发现安眠药的成分因此众人晚上才没有察觉。 Day95比留子带澄野来到停尸房分析受害者的异同。Day96说出了推理：由于面影的乱入，Day43~89杀人魔并没有连体衣与电锯，只能改用锉刀做凶器，而比留子迟迟不说的原因是担心因此而使得“期间目击杀人魔与澄野同框”的证词失效，导致某人受到怀疑...Day97川奈死亡。
Day98澄野起床洗澡时发现自己房间的淋浴室内有血迹，随后拆下换气扇板发现里面有杀人魔的连体衣、电锯，柴刀和雨衣，澄野决定不将这件事告诉给其他人，并将所有物品塞进衣橱内。当天晚上澄野坐在操场的长椅上，随后比留子走来，二人在夜空之下互相依偎着度过了短暂的平静时光。Day99维希涅斯发动袭击，雾藤发现了川奈留下的生物武器并用其重创了维希涅斯，最终维希涅斯被三人联手击败。Day100凌晨，澄野脑内的声音告诉他杀光所有人，随后发现自己的身体不受控制地穿上了防护服。并拿起电锯开始追杀比留子和雾藤。
比留子意识到杀人魔是被寄生的澄野，但澄野此刻已无法控制自己的行动。杀害比留子后，雾藤赶到用灭火器砸向澄野使其行动不能，在看到杀人魔是澄野后，悲愤交加的雾藤用电锯结束了澄野的生命。
澄野将雾藤逼入绝境，虽自身意志想要停下身体却完全不听使唤...雾藤惨遭杀害后，比留子在背后用扳手短暂击晕澄野将他捆了起来，面对手足无措的澄野，比留子将真相娓娓道来...
意识到这一切的澄野让比留子一人独自坐上逃生舱，但比留子拒绝了。导弹发射倒计时所剩无几，比留子没有留下澄野独自离去，而是给了他一个吻...这一刻仿佛就像是永恒，直到整颗星球都被不灭之火彻底吞噬。 |
| 结局073~076 |
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【分歧点：我要......选择：躲开攻击】 澄野与杀人魔搏斗但不敌，杀人魔将电锯逼近澄野却又突然停下，此时雾藤将杀人魔一脚踹出窗外，因为意外电锯砸落在杀人魔身上使其一命呜呼，揭开头套一看竟是面影...（从萌子死后到澄野与雾藤发现前，面影才刚拿到被脱在泳池里的防护服与电锯）
澄野没能忍心杀死雾藤，只能放任凶鸟与自己被丧尸雾藤咬死。Day73~Day99澄野没有知觉，醒来后循着同伴们的声音来到门厅，随后丧尸大军一并涌入，澄野意识到此时自己也是其中一员了。 厄师寺留下殿后，随后在工作技术室中川奈被丧尸凶鸟啃食，丧尸澄野似乎能与站在一旁的丧尸雾藤心意相通。丸子用改锥击杀了丧尸雾藤，澄野将丸子咬死，随后又咬死了银崎，最后只剩下了大铃木... 【分歧点：看着大铃木的脖颈......】
丧尸澄野一时间抑制住了丧尸的冲动。大铃木逃到体育馆后被丧尸大军包围，只身一人用一把电锯击杀了所有丧尸。来到澄野面前时，大铃木希望澄野能够再次发动回到过去的力量拯救所有人，随后含泪击杀了丧尸澄野。
最后除了大脑被破坏的丧尸以外，所有变成丧尸的同学们都登上了逃生舱，向着人造天体飞去...... 【分歧点：要对雾藤动手吗......选择：动手】
与维希涅斯决战时澄野将川奈制作的丧尸诱捕器向其扔去，引来一众丧尸将牢维啃食殆尽...第100天澄野与凶鸟二人即将前往逃生舱时，丧尸们一起涌了过来... 【分歧点：我该做的事情是......】
澄野与凶鸟在千钧一发之际进入逃生舱时，丧尸厄师寺抓住并拧断了澄野的腿，凶鸟在与厄师寺的搏斗中与其一起跌落，最后被丧尸啃食。临死前凶鸟希望澄野能够连同大家的份一起活下去。
澄野独自拖住丧尸让凶鸟成功进入逃生舱，不过丧尸们没有啃食澄野而是将他带到某个地方并限制住行动，最后雌性产卵体女王叽出现将澄野寄生，不灭之火的导弹发射将星球夷为平地。 |
喜剧篇
结局077~084
【分歧点：我要如何应对？选择：躲开攻击】
Chapter15
以下内容含有剧透成分，可能影响观赏作品兴趣，请酌情阅读
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【分歧点：是否应该离开学园呢？选择：选择留下】
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死亡游戏篇
结局085~092
以下内容含有剧透成分，可能影响观赏作品兴趣，请酌情阅读
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宽屏模式显示视频 宽屏模式显示视频 【分歧点：要参加猎杀侵校生吗？选择：参加】
澄野决定参加游戏，借此找出杀害丸子的凶手，然而其他同学除了怠美和没有明确表态的比留子以外都不愿意参加游戏，怠美和澄野商讨计划，让澄野去说服厄师寺，银崎，今马和过子参加死亡游戏。澄野从丸子的尸体上取下外套，将其和SIREI的残骸一起带去给厄师寺看，成功劝说厄师寺参加死亡游戏。之后，在澄野和厄师寺的劝说下，其他三位同学也决定参加死亡游戏，同时怠美也成功劝说其他人参加。
众人赶到休息室，主办者带着一群巨型蜜蜂现身，此时大铃木提出自己拒绝参加游戏，随后被巨型蜜蜂抓起并吸干异血，众人无论如何攻击主办者都无济于事，只好暂时答应主办方的条件。第26天，主办者宣读规则，让大家去猎杀侵校生并获取猎杀积分，每一场游戏持续十天，十天之后积分排名垫底的玩家会被蜂群吸干异血。
澄野决定找人组队合作，然而很快就被其他同学所排挤，澄野找到比留子却发现她已经和怠美组队，只好独自出发猎杀侵校生。独自猎杀的澄野很快陷入包围圈，此时面影出现并提出要和澄野组队。 【分歧点：要和面影组队吗？选择：组队】（若选择“不组队”则进入结局092）
未与其他队友组队的澄野很快孤立无援，被侵校生包围而命不久矣。
澄野和面影组队，并看到比留子和怠美猎杀了大量侵校生，二人毫无意外地排在第一和第二的位置，而澄野和面影则位列三，四名。第27天比留子向澄野提出对抗主办者的计划，让澄野将比留子杀死的蜜蜂尸体交给面影解剖，并调查主办者的真实身份。澄野和伊娃对话，推测主办者是独立于学园学生和侵校生的第三方，澄野因担心伊娃拿到面具后同伴会意识到伊娃也是侵校生并杀死伊娃，这让伊娃受到了很大的心理刺激。 第29天，澄野和面影排在第四和第六，银崎排在最后一名，而很少主动出手击杀侵校生的川奈排在第五，面影指出合作玩家可以对猎杀获得的积分进行分配，而川奈正是通过打辅助提分的。澄野从丧白口中得知主办方似乎24小时不吃饭不睡觉向蜜蜂下达指令，面影在解剖后发现蜜蜂本体其实很脆弱，推测是通过我驱力进行强化的。当天晚上，比留子告诉澄野，怠美热爱死亡游戏是因为怠美在她的家庭里长期受到父母和老师虐待，渴望通过进行死亡游戏的方式让大家一起面对这种视人命如草芥的极端境遇，比留子担心怠美在游戏中死亡一直在照顾着怠美。 第30天两组人一起参加猎杀，比留子在取防护服备用品的路上遭到第三部队长的袭击，面影提出扔下怠美逃跑。 【分歧点：要去救饴宫吗？选择：救】（若选择“不救”则进入结局091）
没能救下饴宫与雫原的澄野被厄师寺与九十九兄妹怀疑是杀害了她们的凶手，于是澄野被关进了笼子，无法再通过猎杀侵校生获得点数，第一轮游戏结束时因为排名垫底惨遭处决。
二人和怠美一起迎战第三部队长，途中怠美杀死身负重伤的比留子并吸收了她的异血。比留子遇袭的事情被川奈目击，之后川奈找到二人并加入对抗主办者的联盟。在这场战役不久怠美便陷入昏迷。 第二天，澄野与主办方对峙，澄野用礼物机做出的十字弓打破了主办方的防护服，之后面影穿着防护服击退了蜂群，随后把小型不灭之火炸弹塞进防护服的破洞并引爆了它，主办者在不灭之火中被烧死。 面影发现主办者死后蜜蜂仍然存活，川奈告诉澄野神秘房间有奇怪的声音，澄野进入房间后发现两个穿着防护服的神秘人从SF线跳跃而来的澄野和比留子，被对方注射麻醉针昏迷一天，昏迷前对方告诉澄野自己与猎杀侵校生游戏无关。第32天川奈告诉澄野自己在寻找QB液，但澄野对此一无所知。
第33天众人击败第三部队长，此时主办者突然出现并吸收了第三部队长的异血，此后其他十几名主办者也一起出现，死亡游戏被重启。第34天，澄野发现逃生舱被基本粒子细菌腐蚀。第35天，澄野去看望分数垫底的银崎，陪伴他度过了他生命的最后一天。此后，银崎遭到处刑被吸干异血。
第36天，澄野把银崎的死讯告诉伊娃，与伊娃达成和解。第38天雾藤病倒，丧白和凶鸟一直在照顾她。第41天，丧白找澄野求助，澄野把从主办者手上获得的部队长异血交给丧白，救下了雾藤。
第42天，雾藤，丧白和凶鸟加入联盟。第44天，澄野得知自己由于吸收了两次苍月的异血，继承了他的杀手天赋，但担心自己可能被苍月取代的顾虑很快被伙伴们的劝慰打消。第45天，川奈找到QB液，但告知澄野修复逃生舱需要五十天的时间。 第46天，众人改变分组计划，由澄野带着分数比较危险的川奈上分。此时的川奈已经对澄野产生了好感。第47天，众人遭遇第十部队长，雾藤身负重伤，丧白提出留下自己一个人拖住第十部队长，其他人带着雾藤回去治疗。 【分歧点：要把丧白留在这里吗？选择：留在这里】（若选择“不留在这里”则进入结局090）
澄野决定大家一起与丧白萌子并肩战斗，回到学园后才发觉中了调虎离山之计，学园已然被侵校生攻破。
丧白牺牲，众人回到学园后迎战第十部队长和第十一部队长，澄野再次将部队长的异血输给雾藤，雾藤恢复后再次产生排异反应，危机之下众人让雾藤吸食伊娃的血液。在吸食的过程中伊娃和雾藤互相感受到对方的人生，伊娃把雾藤视为自己的“女儿”。之后，雾藤长期照顾伊娃，但也因此分数落后。第54天，今马，过子和厄师寺赶到关押伊娃的笼子前把雾藤打伤，试图杀死伊娃以救下分数排名倒数第二的过子，被联盟众人击败。众人放走伊娃，让伊娃和她的另一个“女儿”佳缪见面。
第56天，学生们主动出击进攻进攻侵校生基地，迎战第四部队长。雾藤中途离开去照顾伊娃。在得知雾藤面临的处境后，伊娃决定牺牲自己保住雾藤的性命。 【分歧点：要杀了依娃吗？选择：杀】（若选择“不杀”则进入结局089）
澄野不忍心杀死依娃，但厄师寺与九十九兄妹希望杀掉依娃获取积分，于是两伙人大打出手，最后全军覆没。
伊娃自爆身亡，同时厄师寺和九十九兄妹一起击杀第四部队长，因此凶鸟成为了最后一名。凶鸟自愿牺牲，注射了面影制作的毒药。第二轮游戏结束后主办方不出意料处刑了凶鸟，在吸收凶鸟异血后纷纷中毒倒下，最后一名主办方声称下一任主办者将会到来，并自爆以隐藏自己的真实身份。
【分歧点：要问出藏身之处吗？选择：问】（若选择“不问”则进入结局088）
由于无法找到更多的侵校生，川奈的排名只得一直垫底。临近处刑前澄野决定带着川奈乘坐校车甩开杀人蜜蜂一路向远处奔驰远走高飞。晚上，二人相互依偎在一起畅想着未来，在甜蜜的氛围中闭上了双眼......然而在不知不觉间川奈被一只突然出现的蜜蜂吸干了异血。
【分歧点：应该对抗的敌人是......选择：主办者】（若选择“达尔沙”则进入结局085）
众人决定先专心对付达尔沙。达尔沙被击败后主办者按照规则将其异血分发给了排名前三的队员，正当众人认为终于集齐了发射飞船的燃料后，却发现怎么也找不到佳缪的身影，回头一问主办者才得知佳缪放心不下众人跑出来观战，之后被主办者发现并被杀害。大家不愿意接受这个事实，然而还是在晚上找到了佳缪的尸体。雾藤希情绪激动地冲向主办者，最后被蜂群处决。
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推理篇
结局093~100
以下内容含有剧透成分，可能影响观赏作品兴趣，请酌情阅读
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【分歧点：要参加猎杀侵校生吗？选择：不参加】
【分歧点：杀害过子、刺杀银崎的人是？选择：银崎晶马】（若选择其他同学则进入结局093）
由于澄野的胡言乱语众人决定将他关到笼子里。随后澄野一直昏迷到了Day99，笼子的锁被打开，澄野在校园里发现除自己与雾藤以外的十一人全部死亡，部分同学背后的心脏被剜走部分仍然保留。最后澄野也受到袭击倒在了血泊之中。
【分歧点：杀害银崎的凶手是谁？选择：依娃】（若选择其他人则进入结局094~096，选择澄野拓海则进入结局097） 澄野胡乱指认了一人又说不上理由，众人决定将他关到笼子里。随后澄野一直昏迷到了Day100，笼子的锁被打开，澄野在校园里发现共有9人死亡，此时雾藤、萌子出现在操场上，并指认澄野为凶手，澄野认为... 【分歧点：杀死大家的凶手是......】
萌子听闻后突然暴走，举起一把屠刀向澄野砍去，澄野略施体术夺刀并反杀了萌子，雾藤因萌子之死而丧失了理智，抄起掉落在地上的刀杀死了澄野。
雾藤听后因想起学园里的惨状而放弃了思考，独自一人向不灭之火墙奔去并跃入其中被焚烧殆尽，澄野见状后也丧失了理智跟着跳了进去。
澄野认为二人不可能是凶手，或许是自己无意之间杀了其他同学，并放弃了抵抗。萌子随后用屠刀将澄野斩首。
澄野觉得有很多证据表明自己可能是那个凶手，正当众人想把澄野关起来的时候澄野突然表现出抗拒并一路狂奔逃离，随后拿上灭火器准备离开学园，抵达火墙时发现面影早已恭候多时，并打算杀掉澄野。千钧一发之际雾藤赶到并替澄野挨了面影的一刀，澄野见状后悲愤交加，与面影缠打在一起并向火墙滚去，最后二人被不灭之火蒸发殆尽。
【分歧点：要阻止依娃说下去吗？选择：不阻止】（若选择“阻止”则进入结局098）
澄野担心如果X在众人之中的话，可能因为担心暴露身份而选择引爆炸弹与大家同归于尽，于是阻止了依娃继续说下去。依娃随后放声大笑，认为众人的下场注定是悲惨的，随后主动引爆了身体内的炸弹。
【分歧点：X的真实身份是？选择：九十九过子】（若选择其他人则进入结局099）
澄野猜错咯，于是X一枪把澄野秒了。全作最简陋最敷衍的结局之一
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